在 Safari 浏览器中设置网页自动深色模式保护视力健康，可以通过以下步骤进行：
1. 打开 Safari 浏览器。
2. 点击菜单栏中的“Safari”图标，然后选择“偏好设置”。
3. 在弹出的“偏好设置”窗口中，向下滚动到“显示与外观”部分。
4. 点击“高级”按钮，然后勾选“使用深色主题”选项。
5. 点击“确定”按钮保存设置。
这样，当你浏览网页时，Safari 浏览器会自动切换到深色主题，有助于保护你的视力健康。